历经数十年的发展，如今基因测序技术已经在基础研究、技术研发和临床实践上得到了广泛的应用，据预测，基因测序市场未来五年复合增长率在35%左右，2022年有望突破300亿美元。逐渐完善的检测技术和不断降低的设备成本使基因测序逐渐普及，这一技术对生物科技研究和医学界的影响也越来越大。
不久前，希望组在Github上线了三代测序数据高效纠错、组装软件NextDenovo最新版本V2.0-beta.1，面向全球范围开源并为学术研究和其它非商业用途免费开放。据悉，本次希望组发布的NextDenovo最新版不但解决了现有三代测序数据组装工具资源占用大、运行时间长、组装质量不稳定的瓶颈，还实现了单Contig一条染色体和超大型基因组组装的突破，为利用三代数据组装基因组扫清了组装算法的障碍。
目前华为云基因容器已经率先集成了NextDenovo最新版，用户无需下载源码、编译和安装等复杂过程，可以直接上传脚本进行数据分析，极大简化了使用流程，并且免除了后续资源、应用维护的烦恼。
华为云推出基因容器服务GCS，助力行业突破瓶颈
基因测序对密集计算和海量数据处理能力有较高的要求，尤其是随着第三代基因测序技术的研发和广泛应用，数据量较之第二代有了百倍增长，在呈现更加精准的测序结果的同时，也给基因测序企业带来了算力、存储能力等IT资源的压力。基因测序市场的火爆将这一系列问题逐渐放大，成为阻碍行业和技术发展的“绊脚石”。
2018年，华为云全球首家推出了以Kubernetes为基础的基因容器服务GCS，将基因测序与容器技术完美地结合在了一起。据悉，基因容器服务GCS是华为云在Kubernetes封装了一层关于基因测序的抽象，让基因行业可以迅速部署和使用容器技术，帮助基因行业的用户提高资源利用率，轻松应对波峰波谷，降低环境搭建的复杂性。
具体来讲，针对基因行业普遍存在的工具碎片化、开发语言多样、系统维护困难等瓶颈，华为云的基因容器解决方案有“快、省、易、捷”的特点。
“快”是指极速测序：GCS支持10万容器规模，可以超高并发运行测序分析流程，大幅缩短测序市场，面对大规模并发，得益于高性能容器批量计算平台Volcano的高效任务调度能力，可以避免任务的死锁、减少等待时间，进一步提升测序分析效率;
“省”来自于华为云的高性价比：算力资源按需、按秒计费，CPU和内存则根据业务诉求灵活配比，避免浪费，有效帮助企业降低成本;
“易”在于免运维：基于Severless架构的容器服务，集群资源自动化扩缩容，分析流程根据预置规则可以自动化处罚和执行;
“捷”则体现在华为云带来的一站式服务：将基因测序分析与数据挖掘能力统一到一套流程里面，避免多套系统操作带来的不便。
基于轻量级的容器技术，GCS结合了大数据、深度学习算法，为测序厂商提供了灵活可定制的测序流程、秒级可伸缩的高可靠资源和便捷一站式用户体验，结合希望组在基因行业内多年来的业务积累，更贴近基因测序行业客户的诉求，让基因测序数据的计算更省、更快、更轻松。
技术赋能行业，助力基因企业创新发展
据了解，除希望组外，国内基因行业Top 15的企业中已经有14家采用了华为云的服务。其中，上海其明信息技术有限公司在华为云容器CCI支持下，其基因检测与基因云计算的综合平台GCBI已经完成了25万例基因数据分析和挖掘，协作作出1万多次基于基因信息的临床决策。数据显示，将业务部署在华为云CCI上后，上海其明的实际计算成本降低了30%-50%，实现了K8S和物理资源免运维。
不仅如此，在AI辅助病理诊断应用开发方面，华为云还与金域医学合作取得过突破性进展，金域医学病理专家团队与华为云AI团队合作，首次基于病理形态学，通过深度学习技术，训练出精准、高效的AI辅助宫颈癌筛查模型。该模型在排阴率高于60%的基础上，阴性片判读的正确率高于99%。同时，阳性病变的检出率超过99.9%，是目前国际上已公布的AI辅助宫颈癌筛查的最高水平。
华为云致力于做智能世界黑土地，以信息技术赋能各行各业，并持续加大研发投入，助力千行百业在5G+云+AI的驱动下实现转型升级。华为云与基因行业的跨界结合帮助基因企业解决了底层技术难题，全力聚焦业务创新，未来也必将极大地加速基因测序等科学技术领域的发展。
